多年來城巴過境線巴士發生過的嚴重意外不多,最廣為人知的是發生於1996年11月的202開頂意外,詳情可瀏覽「城巴11米利蘭的故事 – 火警及交通意外」。至於肇事司機,他並沒有因此意外而需坐牢或被城巴辭退,因為當時那條濱河西路雖未正式開放,但亦沒有封閉,而且是施工的工人未有評估風險就將電纜垂低才釀成意外。該司機其後沒有再駕駛202,直到98年才上牌左軚西安富豪1277。

下圖: 此相片為爆頂意外後之車身色彩。自96年11月發生意外後,此車一直進行檢查及維修,直至約97年3月才復出。當時此車一直未有掛牌司機,直至98年才有掛牌司機上牌。

下圖: 另外,其中一部飛天巴士、12米奧林比安339(FG5290)曾於火炭廠附近發生撞牆意外,後來城巴在修復時沒有將上層車頭的冷氣槽回復到原來的模樣。(182170提供新聞、rcbus上載片段、ihmcKyo攝)

九十年代末,180號車曾於廣深高速公路發生意外。事發時巴士正沿該公路向東莞駛去,當駛至近長安時,巴士突然失控,猛力撞向前面一部泥頭車的車尾,巴士車頭嚴重損毁,司機死亡,而所有乘客則沒有受傷。